秦湛，幼承家學，工于文，宋元祐五年（1090）應舉未中，隨侍于父親身邊。紹圣元年（ 1094）秦觀被誣，目為元祐黨人，追論不已，一貶再貶，一直流放到廣東雷州。流放途中，父子失散。宋元符三年（1100），秦觀卒于廣西藤州，秦湛方從湖南奔喪至藤州，與范元長扶櫬北還，因時局不穩，不便還鄉，遂停殯于潭州（即今長沙）并守制。崇寧四年（1105），秦湛奉父櫬離潭州抵高郵，葬于揚州西山蜀岡祖塋。秦湛歷經十余年風雨，方回到故鄉。 由于受元祐黨人子弟的限制，秦湛仕途無望，遂游學于外，成為中官梁師成的座上客，時人非議之。秦湛梁師成座上客，這恐怕與所謂《朱墨史》有關。《齊東野語》中有《朱墨史》一段記載：紹圣中，蔡卞重修《神宗實錄》，用朱黃刪改，每一卷成，輒納之禁中，蓋將盡泯其跡。而使新錄獨行，所謂朱墨本者，世不可得而復見矣。

梁師成在禁中見其書，為秦湛諸人道之，諸人幸其書之出，因回：“此亦不可不錄也。”師成如其言。及敗沒入，有得其書，攜以渡江，遂傳于世。

梁師成自謂蘇（軾）氏遺體，以招延元祐諸家子孫，蘇軾、秦觀有師友之誼，作為秦觀兒子的秦湛自當在被招之列。秦湛則因其父被誣“增損神宗實錄”一貶再貶，謫死道途，為探知其真相，而成為梁師成之座上客，當在情理之中。

秦湛曾通判常州，仕至宣教郞，嘗注《呂好問回天錄》，其詞作僅存《卜算子》及一些斷句，如“藕葉清香勝花氣”為一時盛傳之句。秦湛亦能詩，嘗與李之儀唱和。其文僅見《西菩山寺記》載于《錫山秦氏文鈔》 卷首。