身為道家思想傳承者的傅山，無論在學術和學術思想上，傅山的學問文章，都追蹤當時的進步思潮，尤其是前半生明朝末亡之時，他的思想帶有強烈的進步傾向，不重視當時學者重理學的傾向。他贊揚具有革命新精神，被明朝統治者視作洪水猛獸的李贄學術思想和劉辰翁、楊慎、鐘星等節高和寡之士的文風。對明末的政治腐敗，官場齷齪，是有清醒的認識。清軍入關明王朝滅亡后，傅山一反清初一般學者以經學為中心的研究范圍，而是獨辟研究子學的途徑，沖破宋明以來重理的羈絆，開拓了新的學術研究領域，成為清之后研治諸子的開山鼻祖。至于傅山的詩賦，則是繼承了屈原、杜甫以來的愛國主義傳統，他主張詩文應該“生于氣節”，以是否有利于國家和民族為衡量標準。傅山一生著述頗豐，可惜所著宏論，大都散失，只存書名和篇名，留存于世的僅《霜紅龕集》和《兩漢人名韻》兩部。

在詩、文、書、畫諸方面，傅山皆善學妙用，造詣頗深。其知識領域之廣、成就之大，在清初諸儒中，無出其右者。傅山的書法被時人尊為“清初第一寫家”。他書出顏真卿，并總結出“寧拙毋巧，寧丑毋媚，寧支離毋輕滑，于直率毋安排”的經驗。他的畫也達到了很高的藝術境界，所畫山水、梅、蘭、竹等，均精妙，被列人逸品之列。《畫征錄》就說：“傅青主畫山水，皴擦不多，丘壑磊珂，以骨勝，墨竹也有氣。”他的字畫均滲透自己品格孤高和崇高的氣節，流溢著愛國主義的氣息，在中國古典書畫藝術中，博得后人的高度贊賞。

傅山不僅是書法家、畫家，而且是晚明清初遺民的代表，北方學術思想的領袖，著名學者，甚至被傳為“武林高手”。其人其事早已成為山西一帶的神話傳說。當時道教佛教均尊引為本家。

傅山在思想上有“學海”之稱，僅就自學研究著作而言， 山西省博物館現藏著作目錄有：《老子注》、《莊子注》、《管子注》、《荀子注》、《列子注》、《鬼谷子注》、《公孫龍子注》、《淮南子注》等。

傅山在醫學上，也有著巨大的成就。他內科、婦科、兒科、外科，科科均有很高的技術，而尤以婦科為最。其醫著《傅氏女科》、《青囊秘訣》，至今流傳于世，造福于人。傅山極重醫德，對待病人不講貧富，一視同仁，在相同情況下，則優先貧人。對于那些前來求醫的闊佬或名聲不好的官吏，則婉詞謝絕。對此他解釋為：““好人害好病，自有好醫與好藥，高爽者不能治；胡人害胡病，自有胡醫與胡藥，正經者不能治。”

傅山作為封建社會中的知識分子，一生中處處表現了堅韌不拔的戰斗精神。他那種“富貴不能淫，貧賤不能移，威武不能屈”的品格和氣節，毫不愧對“志士仁人”的評價。

康熙二十三年（1684年）初，傅山的愛子傅眉忽逝，年愈古稀進入風燭殘年的傅山悲痛異常，再也經受不得如此打擊，不久則撒手人寰，與世長辭，時年77歲。

明末清初的思想家傅山歷來有 “學海” 的稱譽， 他工書善畫， 博極群籍， 在經史子集、 文學詩詞、 佛經道藏、 書法繪畫、 鐘鼎文字、 醫學醫術諸領域都有精深研究 ， 所提倡的 “經子不分” ， “經子平等” 思想更是開一代風氣之先， 其研究、 批點諸子著作之多、 內容之廣泛，在中國古代學術史上是少見的。 而諸子當中， 最傾盡其心力、 最能體現其思想風貌的則首推 《莊子》 一書 。

傲骨凜然的傅山一生特立獨行， 對于經典、 名士、權貴時有貶損、 諷刺之語， 獨獨對于莊生、 《莊子》 大加褒揚， 奉為至論， 嗜莊、 好莊、 迷莊之情溢于言表。其留存的詩文、 雜記、 批語中屢屢言及莊子。褒贊莊子、 自認承續莊學的詞文在傅山遺著中隨處可見， 其研究莊子的主要作品有《莊子翼批注》 、 《老莊二書》 、 《逍遙游》 、 《應帝王》 、 《讀南華經》 、 《莊子天下篇》 、 《莊子理字》 、 《莊子情字》 、 《荀卿評莊子》 等， 此外還有大量散布在其他詩文、 雜文中言及莊子的文句 。

傅山一生遍注諸子，在 《莊子》 一書上著力最深，《莊子》 的思想既是其精神的引領， 又是心靈安頓之所歸， 其批注的方式與言述更彰顯著個人活潑潑的生命氣質。詮解 《莊子》 時對天地間 “情” 的推崇、 以 “游” 的姿態應對人間 “是非” 、 主張 “變” 、 “異” 的政治傾向， 正是最能體現其個人特質與思想風貌的三個方面， 通過對其莊學思想的探析， 我們也能從中窺見其性情與學術之梗概 。

對于莊子的著作，在顛沛流離的旅途中，仍然“時時在目”，在冰雪覆蓋北國的嚴冬里，依然用工整的小楷書寫《南華經》多篇。對于老子的著作，三日不讀便覺得“舌本軟”，難以啟齒說話，五十歲過后還在“細注”，進行認真的研究。這些生動的記載說明，他對老莊之學是很推崇與重視的。他在一篇疏文中曾說：“僑黃老子，何笑正笑，漆園自云，其于宗也。”在這里他以“僑黃老子”、“漆園”自況自稱，以承緒老莊之學的大弟子自許。

綜觀傅山一生行事作風與思想主張，可見他本質上是一個道家人物的性情：為人為學本于真性真情、自由自在，反對權威主義教條主義，因此，他極其憎惡“奴儒”為人為學的“奴性”：“若奴人，不曾究得人心空靈法界，單單靠定前人一半句注腳，說我是有本之學，正是咬齫人腳后跟底貨，大是死狗扶不上墻也。”并由此而極力批判當時所謂上流社會是非顛倒的假仁假義。他自己也在很多場合與作品中反復強調、自陳：“老夫學老莊者也”、“我本徒蒙莊”、“吾師莊先生”、“吾漆園家學”、“愚父子學莊列”，還飽含深情地說：“三日不讀《老子》，不覺舌本軟。疇昔但習其語，五十以后，細注《老子》，而覺前輩精于此學者，徒費多少舌頭，舌頭總是軟底。何故？正坐猜度，玄牝不著耳。”“吾莊翁所謂緒余可以為堯舜者也。”

老莊哲學豐富，據史書記載，他們為人自尊，對人間功名利祿很淡漠，一生不得勢也不愿得勢，一生不得志也不愿得志，以窮盡人倫物理為天職。生活的道路對于傅山來說，與老莊十分相似，思想境界亦相通。這些都給傅山很深的影響，因此自然成為他進行研究的主要對象，使他成為明清之際著名的道家代表人物之一。